Madonna Episkopi
Ci sono anche molte chiese che vale la pena di visitare
La chiesa cattedrale ortodossa di Madonna Ypapanti
che festeggia il 2 febbraio, con le bellissime agiografie curate dal pittore di Santorini Cristoforo Asimìs quando si è ricostruita dopo il terremoto del 1956 e il formidabile posto a Firà con vista alla Caldera.Il convento di San Nicola (convento femminile)
che si trova fra Firostefani e Imerovigli.Il convento del Profeta Ilias (convento maschile)
che si trova sulla cima della collina di Pyrgos costituisce un' attrazione importante a Santorini. Costruito il 18° sec. con scolpito templum di legno. Molti impressionanti oggeti religiosi si trovano nel suo museo ecclesiastico.La Sacra Chiesa della Santa Croce a Perissa
la più grande chiesa di Santorini, costruita nel 19° sec. sopra la basilica di Santa Irene.La chiesa di Madonna Akathistos
alla piazza di Ia.La Sacra Chiesa della Presntazione della Madonna
che si trova a Megalochori con templum di legno e icone russe.
La Madonna Maltesa a Imerovigli, Il Sant' Epifanio ad Akrotiri, i Santi Anargyri a Megalochori, i Santi Sette Figli a Ia (in una grotta alla base della Caldera), il San Giorgio Xechreotis a Kolumbo, La Madonna di Kalos a Porì e molte altre, circa 300, che abbelliscono tutta l' isola.